Taxonomía en Grafico de barras

          Al crear una tabla BIOM de referencia cerrada 16S en Qiita, cada secuencia se empareja con la base de datos de Greengenes utilizando un umbral de identidad de secuencia del 97% y se le asigna una taxonomía. Esto permite mostrar los datos para ver el porcentaje de cada taxón dentro de cada muestra.

       Para mostrar los perfiles taxonómicos de las muestras, selecciona el comando  “rarefied table” y clic en "Process". Ahora aparece la misma vista de los comandos disponibles para ejecutar, clic en “Visualize taxonomy with an interactive bar plot” en el menú desplegable para llegar a la siguiente vista:

Los parámetros están fijos para este comando asi que solo de dar clic “Add Command”  y esperar que el flujo de trabajo se ejecute completamente.

Una vez que se elige el artefacto de “q2 visualization”en la red, la gráfica de barras de taxones aparecerá . La gráfica ofrecen visualización de la composición de cada muestra. Cada color representará un taxón diferente y cada columna una muestra diferente. Tendrá cuatro menús desplegables: “Nivel taxonómico”, “Paleta de colores” y dos opciones de “Ordenar muestras”.

El menú "taxonomic level" le permite ver los taxones dentro de sus muestras en diferentes especificidades. Hay 7 opciones de nivel: 1- Reino, 2- Phylum, 3- Clase, 4- Orden, 5- Género, 6- Especies, 7- Subespecies.

El menú "Color Palette" le permite cambiar el color de su diagrama de barras de taxones. Los menús "Sort sample by" le permiten ordenar sus datos por metadatos de muestra o abundancia taxonómica ascendente o descendente.