Rarefacción de Datos

Para ciertos análisis la mejor opción es realizar una rarefacción de los datos esto significa que todas las muestras analizar tienen sus caracteristícas en este caso OTU, reduciendo posibles sesgos de diversidad Alfa o Beta. Se excluye las muestras con menos caracteristicas de la frecuencia mínima mostrada en el resumen estadístico previo o de muy baja abundancia.

            Para utilizar este comando se seleccionará  “Rarefy table[rarefy]” varios parámetros están automáticamente seleccionados. En la opción total de frecuencia de cada muestra utilizaremos “2,248.0” y finalmente “Add Command” y “Run”, esperamos unos minutos mientras Qiita realiza el análisis.

Seleccione el artefacto "rarefied_table (BIOM)" recién generado. Esta vez, en lugar de ver un histograma de las muestras rareficadas, se observará un pequeño resumen que confirma que las muestras se han rareficado a la misma profundidad.