FASTQC
FastQC tiene como objetivo proporcionar de forma simple algunas comprobaciones de control de calidad en datos de secuencia sin procesar que provienen de herramientas de análisis de secuenciación de alto rendimiento. Proporciona un conjunto modular de estudios que puede usar para dar una impresión rápida de si sus datos tienen algún problema que debe tener en cuenta antes de realizar cualquier análisis posterior.
Comandos:
| fastqc 22240_Bt28_1_trimmed.00.0_0.cor.fastq.gz 22240_Bt28_2_trimmed.00.0_0.cor.fastq.gz -o quality_FQC/ |
HTML adjunto
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fastqc 22241_M12J_1_trimmed.00.0_0.cor.fastq.gz 22241_M12J_2_trimmed.00.0_0.cor.fastq.gz -o quality_FQC/ |
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Si lograste con exito tus controles de calidad podemos Ensamblar el genoma